Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2A1P52655 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2A1P52655 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2A1P52655 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms