Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK8P49336 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms