Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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