Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT20P35900 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms