Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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