Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms