Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms