Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA1P17302 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA1P17302 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms