Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPB42P16452 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPB42P16452 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPB42P16452 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPB42P16452 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms