Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms