Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms