Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms