Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VIL1P09327 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VIL1P09327 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VIL1P09327 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VIL1P09327 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VIL1P09327 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VIL1P09327 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms