Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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