Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNC1O60486 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms