Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGSM2O43147 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms