Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01387J3KSC0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01387J3KSC0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01387J3KSC0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01387J3KSC0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LINC01387J3KSC0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LINC01387J3KSC0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01387J3KSC0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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