Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms