Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms