Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms