Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms