Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms