Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASIC3Q9UHC3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms