Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms