Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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