Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms