Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR88Q9GZN0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms