Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms