Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms