Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms