Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms