Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms