Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HINFPQ9BQA5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms