Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms