Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms