Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms