Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 676.3 ms