Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC33Q8N5R6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms