Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3V7

SYNPO, Synaptopodin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPOQ8N3V7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNPOQ8N3V7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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