Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC117Q8IWD4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms