Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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USP43Q70EL4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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USP43Q70EL4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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USP43Q70EL4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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USP43Q70EL4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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USP43Q70EL4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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USP43Q70EL4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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