Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms