Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms