Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RTL6Q6ICC9 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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