Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms