Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms