Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms