Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKOR2Q2VWA4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms