Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms