Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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